Peran Kimia Medisinal Komputasi dalam Identifikasi Anti-Kanker melalui Molecular Docking Senyawa Alam
The Role of Computational Medicinal Chemistry in Identifying Anti-Cancer Agents through Molecular Docking of Natural Compounds
Abstract
Kanker tetap menjadi tantangan kesehatan global dengan terapi konvensional yang seringkali menimbulkan efek samping serius. Senyawa alam menawarkan potensi sebagai sumber agen antikanker baru yang lebih aman dan selektif. Artikel review ini membahas peran Kimia Medisinal Komputasi, khususnya teknik molecular docking, dalam mengidentifikasi senyawa alam Indonesia sebagai kandidat antikanker. Metode penulisan menggunakan tinjauan literatur sistematis dari database Google Scholar, ScienceDirect, dan PubMed (tahun 2021-2025), yang menyaring 11 artikel relevan untuk dianalisis. Hasil kajian menunjukkan bahwa pendekatan in silico ini berfungsi sebagai filter awal yang efisien untuk memprediksi interaksi senyawa (seperti Squalene, Tetradec-13-en-11-yn-1-ol, dan ?-Bourbonene) dengan reseptor target kanker (seperti EGFR, HER2, dan ER-?). Pipeline penelitian yang dijalani bersifat integratif, mencakup analisis afinitas ikatan, prediksi profil farmakokinetik dan toksisitas (ADMET), serta validasi stabilitas kompleks melalui simulasi dinamika molekuler. Simpulannya, Kimia Medisinal Komputasi merevolusi penemuan obat antikanker dengan menjadikannya lebih rasional dan terarah, meskipun validasi eksperimental tetap mutlak diperlukan untuk mengonfirmasi potensi kandidat senyawa yang diidentifikasi.
References
Alhayyani, S., Akhdhar, A., Asseri, A. H., Mohammed, A. M. A., Hussien, M. A., Roselin, L. S., Hosawi, S., AlAbbasi, F., Alharbi, K. H., Baty, R. S., Kalantan, A. A., & Ali, E. M. M. (2023). Potential Anticancer Activity of Juniperus procera and Molecular Docking Models of Active Proteins in Cancer Cells. Molecules, 28(5). https://doi.org/10.3390/molecules28052041
Amin, S., Azijah, R. N., & Gunawan, F. R. (2024). Eksplorasi Senyawa Alami sebagai Lead Antikanker Payudara dengan Pendekatan In Silico. Jurnal Ilmu Medis Indonesia, 4(1), 63–74. https://doi.org/10.35912/jimi.v4i1.4560
Amin, S., Fauzan, M., Zidane, M., Program, F., Farmasi, S., Farmasi, F., Tunas, U. B., & Tasikmalaya, H. (2024). Studi Komputasi Potensi Anti-Kanker Payudara dari Senyawa Bioaktif Daun Belimbing Wuluh. Prosiding Seminar Nasional Diseminasi Penelitian, 4, 317–331.
Amin, S., Puspatiara, A., Awaliah, F., & Zulvania, W. (2025). Kajian Potensi Senyawa Aktif Bahan Alam sebagai Inhibitor Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 (Her-2) pada Kanker Payudara?: Kajian Penambatan Molekuler. Jurnal Riset Rumpun Ilmu Kesehatan, 4(1), 338–344. https://doi.org/10.55606/jurrikes.v4i1.4602
Amin, S., Syamsudin, A., Ziani, & Yustianti, F. (2025). Sinergi Kimia Medisinal dan Komputasi Modern dalam Penemuan Obat Antikanker dari Sumber Alam. Indonesia Research Journal on Education, 5(3), 1079–1085.
Amin, S., & Tsani, G. A. (2025). Tinjauan Literatur: Molecular Docking Fitokimia Indonesia Terhadap Target Terapeutik Empat Jenis Kanker. Journal of Public Health Science, 2(2), 183–190. https://doi.org/10.70248/jophs.v2i2.2191
Ananto, A. D., Muliasari, H., & Hamdin, C. D. (2020). Studi In Silico Bioaktivitas Antikanker Senyawa Aktif Dalam Minyak Biji Buah Wali [Brucea javanica (L.) Merr]. Sasambo Journal of Pharmacy, 1(2), 26–29. https://doi.org/10.29303/sjp.v1i2.13
Asma, S. T., Acaroz, U., Imre, K., Morar, A., Shah, S. R. A., Hussain, S. Z., Arslan-Acaroz, D., Demirbas, H., Hajrulai-Musliu, Z., Istanbullugil, F. R., Soleimanzadeh, A., Morozov, D., Zhu, K., Herman, V., Ayad, A., Athanassiou, C., & Ince, S. (2022). Natural Products/Bioactive Compounds as a Source of Anticancer Drugs. Cancers, 14(24). https://doi.org/10.3390/cancers14246203
Astuti, N., Anggraeni, S. R., Andriani, M., & Agustina, A. (2021). Studi in silico senyawa kaempferol pada herba kelakai ( Stenochlaena palustris ( Burm . f .) Bedd .) sebagai kandidat antikanker payudara. Prosiding Seminar Nasional Dan Penelitian Kesehatan, 178–186.
Dinata, D. I., Muttaqin, F. Z., Sodik, J. J., Irfani, A. M., & Binawan, Y. N. (2025). In Silico Study of Flavonoid Derivative Compounds against ER-? as Anticancer. Indonesian Journal of Pharmaceutical Science and Technology, 12(2), 166–175. https://doi.org/10.24198/ijpst.v12s2.60035
Ertu?rul, M. S., Balp?nar, Ö., Can Aytar, E., Ayd?n, B., Incilay Torunoglu, E., Durmaz, A., & Rossato Viana, A. (2025). Antioxidant, Antimicrobial, Anticancer, and Molecular Docking Insights into Pancratium maritimum Seeds and Flowers: A Phytochemical Approach. ChemistryOpen, 14(2). https://doi.org/10.1002/open.202400407
Gurung, A. B., Ali, M. A., Lee, J., Farah, M. A., & Al-Anazi, K. M. (2021). Molecular docking and dynamics simulation study of bioactive compounds from Ficus carica L. With important anticancer drug targets. PLoS ONE, 16(7 July), 1–16. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0254035
Hakiki, A., Andika, A., & Rahmawati, R. (2024). Studi Molecular Docking dan Prediksi ADMET Senyawa Turunan Kurkumin Sebagai Inhibitor Kasein Kinase 2-?. Lumbung Farmasi: Jurnal Ilmu Kefarmasian, 5(2), 195. https://doi.org/10.31764/lf.v5i2.22563
Kamila, N. C., Amin, S., Sriwahyuni, A., & Januar, A. (2025). Prediksi Aktivitas Antikanker Babandotan dengan Pendekatan Kimia Medisinal dan Komputasi In Silico. Jurnal Riset Rumpun Ilmu Kesehatan, 4(1), 345–351. https://doi.org/10.55606/jurrikes.v4i1.4575
Kar, P., Oriola, A. O., & Oyedeji, A. O. (2024). Toward Understanding the Anticancer Activity of the Phytocompounds from Eugenia uniflora Using Molecular Docking, in silico Toxicity and Dynamics Studies. Advances and Applications in Bioinformatics and Chemistry, 17, 71–82. https://doi.org/10.2147/AABC.S473928
Khudzaifi, M., Kalsum, A. S., & Nisak, A. Z. (2024). Molecular docking Senyawa Flavonoid Daun Sirsak (Annona muricata L.) Terhadap Reseptor Estrogen Alfa (RE-?) Sebagai Kandidat Obat Antikanker Payudara. Sains Medisina, 3(1), 1–9.
Ma’ruf, H. S., Ramadhan, M. A., Syafriadi, R., & Suryani, O. (2025). Molecular Docking Senyawa pada Buah Mengkudu (Morinda Citrifolia L.) terhadap Reseptor PDGFR-a sebagai Kandidat Antikanker Paru-Paru. Jurnal Medika Farmaka, 3(24), 303–310. https://doi.org/10.33482/jmedfarm.v3i1.62
Mendie, L. E., & Hemalatha, S. (2022). Molecular Docking of Phytochemicals Targeting GFRs as Therapeutic Sites for Cancer: an In Silico Study. Applied Biochemistry and Biotechnology, 194(1), 215–231. https://doi.org/10.1007/s12010-021-03791-7
Pandawangi, S., Khonsa, & Lalita, D. (2025). Molekular Docking Aktivitas Senyawa Anti Kanker Alami Terhadap Kanker Serviks Dari Beberapa Tanaman Obat: Literatur Review. Medic Nutricia, 11(5), 25–31. https://doi.org/10.5455/mnj.v1i2.644
Reynaldi, M. A., & Setiawansyah, A. (2022). Potensi anti-kanker payudara tanaman songga (Strychnos lucida R.Br): Tinjauan interaksi molekuler terhadap reseptor estrogen-? in silico. Sasambo Journal of Pharmacy, 3(1), 30–35. https://doi.org/10.29303/sjp.v3i1.149
Sathish, V., Gayathiri, E., Pratheep, T., Prakash, P., & Umavathi, S. (2025). Metabolites profiling based antioxidant, anti-cancer cell proliferation activity and molecular docking and stimulation studies of Parthenium hysterophorus L. Microbe (Netherlands), 6(September 2024), 100238. https://doi.org/10.1016/j.microb.2025.100238
Syaqila, C. N., Pebralia, J., & Restianingsih, T. (2024). Molecular Docking Senyawa (8)-Shogaol Sebagai Obat Antikanker. Journal Online of Physics, 9(3), 72–76. https://doi.org/10.22437/jop.v9i3.36116
